卻說朱元璋取得太平城後，太平城內一直都非常安定；只有城外一帶，還屬於元兵的勢力範圍。元中丞蠻子海牙調集巨艦，截住了採石嘰的姑孰口，並檄令義軍元帥陳埜先及副將康茂才，率領兩萬水陸軍，前去攻打太平城。
朱元璋乘他們剛到，還來不及休息，立即率領諸將出戰，一面命令徐達、鄧愈帶兵繞道至敵人後方，悄悄埋伏在襄城橋。
陳埜先來到太平城下，摩拳擦掌，只等著大戰一場。不久，城門大開，守兵一齊殺出，後面緊跟著許多身強力壯的士卒，擁著一位大元帥，那人看起來英姿颯爽，器宇不凡。陳埜先正暗暗驚嘆，忽然看見空中出現一道霞光，結成黃雲籠罩在朱元璋的麾蓋上方，仿佛是在護著他一般，愈發覺得驚疑不定。他手下的將士也紛紛擡頭來看，不料朱元璋已麾兵殺來。雖然陳埜先一方人多，還是難以抵擋朱元璋的猛烈攻勢。迫不得已，陳埜先只好率領衆人退到襄城橋。
突然這裡炮聲齊鳴，徐達、鄧愈的兩路兵馬，從左右殺了出來；急得陳埜先無路可逃，只好提起長槍，來戰鄧愈。兩人打了幾個回合，鄧愈用矛格槍，舒開猿臂，把陳埜先活捉了回去。
剩下的康茂才等人見主帥被擒，紛紛逃走。有一半跑得慢的，都做了刀下鬼。康茂才成功逃走，隱遁了起來。
徐達、鄧愈得勝回城後，立即將陳埜先推進了朱元璋的大帳。朱元璋命左右給他鬆了綁，然後好言安撫他。
陳埜先說：「要殺就殺，我可不是貪生怕死之輩！」
朱元璋聽了，問他：「現在天下大亂，豪傑並起，打贏了別人歸附你，輸了呢你就歸附別人。你既然自稱爲豪傑，那應該也懂得變通呀！爲何要一心尋死？」
陳埜先遲疑了半晌，方才答應歸順朱元璋。遲疑二字，已爲下文做好了鋪墊。
朱元璋很高興陳埜先的歸降，就令他去招降他的那些舊部下。陳埜先領命而去，當即發去降書，招降舊部。
陳埜先離開後，馮國用向朱元璋進諫道：「此人賊頭賊腦，元帥可不能輕信他的話呀。」朱元璋聽了後並不作聲。
第二天，陳埜先來到朱元璋的帳中，說自己的部下大多來降。朱元璋令他召入，一一記下了他們的名字，仍命陳埜先繼續統領這些人，陳埜先拜謝後就離開了。
在這期間，朱元璋又命徐達等人，分道攻城略地，溧水、溧陽、句容、蕪湖等地，接連被攻取。當他正準備攻打集慶路時，陳埜先忽然自告奮勇地說：「承蒙元帥不殺之恩，我願意帶領部下，前去拿下集慶。」
朱元璋點頭應允，馮國用暗中諫阻，朱元璋說：「人各有志，從元軍還是從我，就看他自己怎麼選吧。」
陳埜先離開後，過了幾天，派人送來了一封信，朱元璋打開一看，只見上面寫著：
集牀城右環大江，左枕崇崗，三面據水，以山爲郭，以江爲池，地勢險阻，不利步戰。昔王渾、王浚造戰船，謀之累年，而蘇峻、王敦，皆非陸戰以取勝，隋取江東，賀若弼自揚州，韓擒虎自廬州，楊素自安陸，三道戰艦，同時並進。今環城三面阻水，元師與苗軍聯絡其中，建寨三十餘里，攻城則慮其斷後，莫若南據溧陽，東搗鎮江，據險阻，絕糧道，示以持久，集慶可不戰而下也。
朱元璋看到這裡，囅然一笑，隨即將信拿給李善長看。
李善長看完後，說：「陳埜先真狡詐啊，看來是想讓我們曠日勞師。」一語道破陳埜先的詭計。
朱元璋說：「無須煩勞你多言，只勞你替我答覆一下他吧。」
李善長應命，隨即提筆寫道：
歷代之克江南者，皆以長江天塹，限隔南北，故須會集舟師，方克成功。今吾渡江據其上游，彼之咽喉，我已扼之，舍舟而進，足以克捷，自與晉隋形同勢異，足下奈何舍全勝之策，而爲此迂迴之計耶？此復。
寫完，李善長將其拿給朱元璋看，朱元璋連連鼓掌說寫得好，隨即讓來使帶著李善長的回信回去向陳埜先復命，並命張天祐到滁陽，邀請郭天敘一起助攻集慶。此舉其實另有深意。
郭天敘見到張天祐，從他那裡聽說朱元璋的邀請後，有些猶豫不決，張天祐對他說：「集慶拿下了之後，我們就能在南面稱帝，到時候北圖中原，還有什麼好怕的？」
張天敘聽了非常高興，當即發兵，也不等和朱元璋會合，就和張天祐率軍東下。
剛到秦淮河，兩人就碰上了奉命帶兵前來阻攔他們的元南台御史大夫福壽，兩下對壘，福壽執著大刀，左旋右舞，勢頭特別兇猛，不僅張天敘打不贏他，就是張天祐和他戰了數個回合，也殺得渾身是汗，撥馬逃回。
張天敘正敗逃時，路上忽然遇見一隊人馬，爲首的一員統領，提著一桿長槍向他迎來，張天祐定睛一看，原來是陳埜先。張天祐很高興，還以爲陳埜先是來救急的，連忙衝上前去打招呼。誰知兩人的馬擦身而過的時候，張天祐竟被陳埜先一槍刺中了喉嚨，當即倒斃馬下。
張天敘見張天祐被殺，知道這次凶多吉少，想要從旁逃走，這時，正巧福壽趕到，手起刀落，將他砍成了兩段。還沒嘗到做皇帝的滋味兒就先去見閻羅王了。
陳埜先接著與福壽合兵，將張天祐和張天敘兩人的餘黨殺了個七七八八，有幾個命不該死的，逃回去向朱元璋通報了這個消息。
陳埜先一路追趕這些逃兵到了葛仙鄉，葛仙鄉里有數百民兵，爲首的叫盧德茂，頗有些大俠氣概。他聽說陳埜先正在葛仙鄉里肆行劫掠，便偷偷派了五十個壯士，穿上青衣，拿著美食美酒假裝去迎接陳埜先。
陳埜先不知是計，帶著十多個騎兵走在前面。走了幾里路，途中青衣兵忽然從後面發起突襲，把陳埜先和他的十幾個護衛殺得片甲不留。偷襲別人的人最終也被別人偷襲了，可見狡詐沒什麼好處。
等到陳埜先的兒子陳兆先，得知消息後前來報仇的時候，盧德茂早就逃走了，葛仙鄉的鄉民也逃得差不多了，鄉里只剩下了幾百間毫無價值的空屋，沒有什麼可以殺掠的，陳兆先只好又帶兵返回了方山。
朱元璋聽說了這些消息後，一面收編了張天敘的殘兵，一面下令進攻方山爲張天敘報仇。說是爲張天敘報仇，不過是借名興師，此乃計中有計。
這時，忽然又接到軍報，說是蠻子海牙帶著數萬水師，重新奪回了采石磯，馬上就要進攻太平了。朱元璋聽到這個消息非常氣憤，想親自去把采石磯再奪回來。
常遇春挺身而出，道：「不用元帥親征，只要末將前去，就可以殺退那個傢伙。」
朱元璋點了點頭，叮囑他說：「你這次去，一定要小心，如果有什麼閃失，太平即使還能保住，和州必會遭到陷落。到時候大家的家眷，就都會遭到毒手。」
常遇春領命，率著廖永忠、耿炳文等人，駕船而去。還沒等他們趕到采石磯，蠻子海牙就已經將戰船聯結起來，做好了開戰的準備。常遇春授予諸將密計，讓各船散布江心，從四面攻擊，自己則領著一名矯健的士卒，駕著一艘大船，奮勇衝擊。蠻子海牙倒也不怕他，仗著船大兵多，麾旗與他們展開了激烈的戰鬥。
特別值得一提的是，此時已經是至正十六年春天，江面有風，水波蕩漾。緊要關頭插入此文，看似無關緊要，其實非常關鍵。
一開始，蠻子海牙一方是順風的，所以射擊起來，十分輕便。誰知交戰了半天之後，風勢忽然逆轉，常遇春一方的將士，竟然順著風向放起火來，風助火烈，火仗風威，霎時間，就把蠻子海牙船上的纜繩燒斷了，將纜繩分成了數截，船跟著也被燒了起來，連撲救都來不及了，元軍哪還有心思戀戰？
這時候，常遇春指揮著左右船隻從四面聚集過來，將士們紛紛跳上敵船，一陣亂砍亂剁，可憐一班元兵，不是跳水被淹死，就是被砍死。蠻子海牙一看優勢盡失，急忙跳上小舟逃走了。元軍的所有兵艦都被常遇春等人奪下，可以說是凱旋而歸。
自此之後，江上再也沒有一個元兵，高瞻遠矚的朱元璋沒了後顧之憂，自然全心全意帶領部下朝集慶路進發。真是水陸並行，兵威浩蕩。可陳兆先仍然不知死活，竟然率兵前來爭戰。
一場角逐過後，不僅生擒了陳兆先，收降了他的三萬六千人，陳兆先也心甘情願投誠了朱元璋。從朱元璋不殺陳兆先就可以看出來，所謂的爲張天敘復仇，只不過是一個藉口罷了。
將士們擔心受降的人太多，怕出什麼亂子。
朱元璋說：「去逆效順，做什麼樣的選擇，要看他們自己，放心吧。」當下就在受降的三萬多人中選出了五百名勇士，讓他們守衛在自己的牀邊。帳中除朱元璋外，只留下馮國用一人。
朱元璋脫去鎧甲，上牀睡去，一夜酣眠，什麼事情都沒發生，衆人這才放下心來。
過了幾天，朱元璋又令馮國用帶著那五百個降士衝鋒陷陣，那五百人感激朱元璋的不殺之恩，在蔣山一鼓作氣擊退了元兵，接著直達金陵城下。
元軍將領福壽築下柵欄，屯兵固守金陵。馮國用帶領部下前仆後繼，徐達、常遇春等人也接踵而上，你推我扳，竟然將元軍的屏障攻破了。元兵四散而逃，可元將福壽仍然拼死抵抗，督兵出戰，徐達等人寡不敵衆，又被殺退。
徐達、常遇春等人隨即加大圍攻力度，一連攻了幾天，方才乘隙登上城樓，不料福壽仍頑強抵抗，又與他們展開巷戰，戰鬥到天明，直到福壽精疲力竭，方大喊了一聲「城在人在！城亡我亡！」說完，舉起劍往脖子上一抹，頓時鮮血四濺，倒地斃命。真是一位難得的忠臣。
金陵城已被攻破，衆將奉迎朱元璋入城，朱元璋一面安撫民衆，一面召集官員和父老鄉親，溫言對他們說道：「元朝失了民心，導致生靈塗炭，我等來此無非是想爲百姓除害，你們不用害怕，以前幹什麼現在還幹什麼。有才能的賢人君子，若能跟隨我，我自當重用。舊的政策有什麼不好的地方，也請你們直接提出來，我一定立即廢除。官吏不可貪婪、殘暴，虐待我的人民！」
衆人聽了朱元璋的話，十分欣慰，幾乎沒有不拍手稱讚的。他們拜謝離去之後，各處的義軍，一個接一個地，依次前來歸順朱元璋，康茂才等人全都聞風而來，加入到了朱元璋的麾下，朱元璋一共得到了五十萬兵士，於是就將集慶路改爲了應天府，設立天興建康翼元帥府，任廖永安爲統軍元帥。禮聘儒士夏煜、孫炎、楊憲等十多人，對他們一律錄用，又以福壽爲元殉節，氣節高尚，將他厚葬，至此，金陵城方才全部被平定。
接著，朱元璋又命徐達爲大將，率領諸將渡江東下，攻克鎮江，又分兵下金壇、丹陽等縣，以湯和爲統軍元帥，駐守鎮江，再命鄧愈、邵成、華高、華雲龍等人，率兵攻克廣德路，並改廣德路爲廣興府，隨後，就以鄧愈爲統軍元帥，駐守廣興。
經過了這麼久的征戰，現在的朱元璋已經是威名遠揚，衆將士於是以朱元璋威名日漸顯著爲名，勸他改稱爲王，朱元璋不答應，只肯自稱爲吳國公，設立江南等處行中書省，自己親自管理省內事務；任李善長、宋思賢爲參議，陶安、李夢庚等爲左右司郎中員外郎都事等職位；又設立江南行樞密院，讓徐達、湯和一起擔任樞密院的事務；設立帳前親軍，任馮國用爲總制都指揮使；設前、後、左、右、中五翼元帥府，及五部都先鋒，所有的官員、職責、制度設立得清清楚楚、井井有條。隨後，又派人去和州迎接家眷，將他們護送到元帥府。一家團聚，其樂融融，大明朝兩百多年的基業，便自此創始了。
接著徐達、湯和等人南下鎮江，收降了強盜頭目陳保二，等到徐達帶兵歸來，湯和再次入僉樞密院事，陳保二就叛變了，他竟然誘騙詹、李兩個守將，抓著他們投奔張士誠而去。
張士誠此時一連攻陷了平江、松江、湖州、常州等地，還招降了蠻子海牙的殘兵，聲勢比以前大多了，陳保二來歸降，張士誠當然不會拒絕，還將詹、李二將給關了起來。
消息傳到應天府，朱元璋擔心兩名手下慘遭毒手，只得先與其通好，以便索還二將。於是他寫了一封信，命楊憲送到平江給張士誠。信上寫著：
昔隗囂據天水以稱雄，今足下據姑蘇以自王，吾深爲足下喜。吾與足下，東西境也，睦鄰守圉，保境息民，古人所貴，吾甚慕焉。自今以後，通使往來，毋惑於交構之言，以生邊釁。
張士誠讀到這裡，將信扔到地上，大怒道：「朱元璋這是將我比作隗囂！」恐怕你還不如隗囂呢。說罷，便喝令左右將楊憲拘禁起來，當即發水師攻打鎮江。
朱元璋立即派遣徐達前往龍潭禦敵。徐達到了龍潭，把張士誠的軍隊打得落花流水，本以爲張士誠這下不敢再來了，於是收兵回鎮江。誰知張士誠拿不下鎮江，卻偷偷襲擊了宜興，守將耿君用來不及防備，城陷身亡。
朱元璋知道消息後大驚，忙派人去通知徐達說：「張士誠詭計多端，已經公然和我們爲敵。他現在得了宜興，可見野心不小。將軍請速速出兵常州，以進爲守。」這一計叫襲魏救趙。徐達收到命令後，立即發兵向常州進發。
常州就是過去的毗陵，徐達到達常州後，就築起堡壘進行圍攻，張士誠派張、湯二人前來支援。徐達知道後，立即退軍十八里，設下埋伏以等待他們到來，自己帶著一些老弱殘兵前去誘敵。
張、湯二人趕來一看，發現徐達的兵都是些老兵殘兵，有些甚至連兵器都配不齊整，亂七八糟的，不禁大笑起來，相互開玩笑說：「人家說朱元璋用兵如神，我看都是一些烏合之衆罷了，根本不值得一提嘛！」說完，就麾兵出戰，上前廝殺。見對方來勢洶洶，徐達邊戰邊退，雙方一走一追，不覺間，走了十多里地。
突然間，路旁閃出數千鐵騎，橫衝而來，領先的一員大將身穿鐵盔鐵甲，好不威武，手裡還提著方天畫戟，直朝張、湯二人刺去。讀者諸君可知這人是誰？他就是徐達的手下，行軍總管趙均用。
張、湯二人見趙均用殺了出來，知道是遇上埋伏了，慌忙用槍招架。兩個打一個本來就有些費力，誰知徐達也翻身殺了過來。張、湯二人見毫無勝算的希望，騎著馬就往回跑去，走了沒多遠，又聽見一聲呼哨，伏兵復起，嚇得張、湯二人魂飛九霄，連坐騎都駕馭不住了，吱溜一聲，全都馬失前蹄，摔倒在了地上。
這時，趙均用恰好趕了上來，兩人就這樣被生擒。此段依據的是《士誠本傳》，不是《紀事本末》。
剩下的士兵見主帥被擒，紛紛潰逃，回去報告張士誠。
張士誠聽到大敗的消息後十分惶恐，於是上書向朱元璋求和，派副將孫君壽將信送到應天府，說是願意每年奉送軍糧二十萬石，黃金五百兩，白金三百斤。
朱元璋回信，責備張士誠說，因爲你故意挑釁，所以是罪有因得。既然你願意求和，就應該先放回我派去的使者和被你扣押的守將，而且每年的軍糧要增加到五十萬石。當即令孫君壽拿著信回去復命。
一轉眼，十幾天過去了，張士誠並沒有再回復。
又過了幾天，徐達傳來軍報說：「鎮江的新附軍被張士誠騙降了，在牛塘叛變，我差點被他們困住，幸好常遇春、廖永安、胡大海等人趕來支援，方才脫險。現已抓住了張士誠的部將張德。」
朱元璋勃然大怒，立即命耿炳文帶一萬人進攻長興，俞通海、張德勝等帶水兵攻打太湖，張鑒、何文正募淮軍攻打泰興，趙繼祖、郭天祿、吳良等攻打江陰，一起圍攻張士誠。一面催促徐達馬上拿下常州，不得有誤。
一切進展得如火如荼。
張士誠聽說常州告急，忙派呂珍去增援，又命趙打虎趕去援救長興。耿炳文來到長興城下，守將李福安、答失蠻等人登城守御。雙方正相持未決，適值趙打虎到來，不等他喘息過來，耿炳文就對他迎頭痛擊，趙打虎站不住腳，退走到了城西門。不料城門緊閉，叫了好幾次也叫不開，後面追兵又來了，情急之下，趙打虎只好朝湖州逃去。
其實趙打虎是個非常有名，也很強悍的頭目，自從投到張士誠部下後屢建奇功，這次來援救宜興，城守李福安等人，還以爲他能輕而易舉地擊敗敵軍，沒想到剛來就被打敗了，衆人這才知道耿軍的厲害，於是就想要獻城投降，等到趙打虎敗走後，隨即就出城投降了。
拿下宜興後，耿炳文得到了三百多艘戰船，他立即向朱元璋報捷。朱元璋下令設立永興翼元帥府，任耿炳文爲元帥，統兵居守。
張士誠不死心，又派遣左丞相潘原明，元帥嚴再興前來攻打長興。潘原明等人還沒到城下，就遭到了耿炳文的偏將費聚的突襲，一下就損失了數百人，潘原明等人敗逃。
現在只有常州還沒拿下，常遇春兵分四路，截斷了城裡的糧道，城中的士兵沒有糧食吃，不免都有些惶急起來。呂珍屢次出城突圍，都被徐達擊退。不久，城裡的糧食全部吃完了，剩下幾千餓著肚子的士兵，哪裡還支持得住呢？呂珍也顧不上守城了，半夜打開城門，衝出重圍，自顧自地逃命去了。城中無主，常州自然失陷，徐達領兵入城。
徐達從至正十六年九月開始圍困常州，到十七年三月才拿下，也算是一次苦戰。我有詩讚賞徐達：
輟耕隴上喜從龍，
迭戰江東挫敵鋒。
不是濠梁應募去，
誰知鄉曲有奇農。
前半章主要寫攻下集慶，後半章則主要寫攻下常州。集慶易守難攻，常州可進可退，都經歷了一場苦戰。這是朱元璋的王業建成之始，也是徐達的首次大功告捷。