太祖處死胡惟庸後，又將陳寧等人一併處置了，同時宣布廢除中書省，以後不再設丞相。
塗節雖然自首，但太祖還是因爲他曾參與了謀劃而賜予他死刑。
太祖以專權枉法之罪殺了胡惟庸後，胡案就成爲他打擊異己的武器，以致受牽連而被殺者達三萬多人。李善長、陸仲亨和費聚三人是太祖的患難之交，他不忍心看著他們死，所以就沒有加罪於他們。後來，聽說雲奇傷重身亡，太祖非常惋惜，追封他爲右少監，賜葬在鐘山。翰林學士承旨宋濂那時已經罷官，但他的二兒子宋璲和長孫宋慎都被胡惟庸案連坐，宋濂因此而被牽連，被押送到京城，準備投進大牢不日處死。
馬皇后進諫太祖說：「百姓家裡給兒子請個老師都非常敬重，況且宋濂親自教過皇子，難道不能赦免他嗎？」
太祖說：「他是逆黨，怎麼能赦免？」
馬皇后又說：「宋濂早就告老還鄉了，他一定不知道這件事。」
太祖生氣地說：「你一個婦道人家知道什麼？」
馬皇后低頭不語。
後來，馬皇后服侍太祖用膳時沒有準備酒肉，太祖問爲什麼，馬皇后流著淚說：「臣妾想到宋先生將要被斬首心裡難過，願意代皇子們服喪。」太祖聽了扔下筷子，當即赦免了宋濂，並安排他去茂州。可惜宋濂走到夔州時就因病逝世了，享年七十二歲。
宋濂教導太子十一年，言傳身教，兢兢業業。他一生從文，嚴於律己。日本使者曾用百金換他一篇文章，宋濂都不答應。當時，海外各國派使者前來訪明的時候，一定會先問宋濂身體是否還好。所以，宋濂死時，朝野上下和海內外各國都爲他感到痛惜。
洪武十四年秋，太祖任命傅友德爲征南將軍、藍玉爲左副將軍、沐英爲右副將軍，率兵三十萬征討雲南。
雲南又叫滇地。漢武帝時，有一朵彩雲出現在南方，漢武帝派人去查探，發現在洱河，因此在那裡增設了雲南郡。唐朝以後，雲南被段興智占據，國號大理。後來，元世祖南下擒住了段興智，然後封自己的第五個兒子忽哥赤爲雲南王，讓段氏子孫協助鎮守邊疆。元順帝時期，把匝剌瓦爾密被明玉珍攻擊逃去了金馬山，後來大理的援軍趕到，擊退了明玉珍。接著一直到元朝滅亡，雲南都一直由元人統治著。
太祖覺得雲南地處偏僻，不想用兵攻打，就特命翰林院待制王禕前去招降，誰知元順帝反而向王禕征糧，脅迫他投降，王禕不肯，竟慘遭殺害。
王禕殉職後，太祖又派湖廣行省參政吳雲前去招降，結果又被殺害。太祖無可奈何，只好下令讓傅友德等人南征。
傅友德來到湖廣，調都督郭英、胡海、陳桓等人帶五萬人從四川永寧進入烏撤，自己則率領大軍由辰沅抵達貴州，一路上攻克了普定、普安。元朝的梁王把匝剌瓦爾密派遣司徒平章達里麻率兵十萬鎮守在曲靖抵抗明軍。
沐英向傅友德獻計說：「元兵認爲我們遠道而來，深入一定需要時日，如果我們加快腳步的話就可以出其不意，攻其不備，到時就一定能破敵。」傅友德點頭表示贊同，隨即下令日夜趕路。
快到曲靖的時候，天忽然起了大霧，四周一片茫然。明軍冒著大霧繼續前進，一直趕到白石江。白石江在曲靖東北地區，距離城池不過幾里地。達里麻這才得知消息，急忙帶著精銳部隊過江攔截。傅友德又採用了沐英的計策，讓大軍做出要過河的樣子，暗中卻讓人從下流過江，襲擊達里麻的後方。達里麻大吃一驚，急忙又派人抵擋後面。
沐英見敵人有變，知道他們已經中計，於是下令立刻渡江，向前殺去。元軍腹背受敵，自然抵擋不住，被逼退了幾里路。明軍緊追不捨，沐英親自衝到最前面，直奔達里麻跟前。只聽沐英大喝一聲，挺起槍就朝達里麻刺了過去，達里麻被他一嚇，竟然摔倒馬下，被明軍生擒。
這場戰役一共俘虜兩萬多人，沿途兩公里都是戰死的士兵。傅友德後來將俘虜的士兵全部放了，讓他們回去自謀生計，雲南百姓因此對傅友德的隊伍好感倍增。
傅友德派藍玉、沐英等人去雲南，自己則帶著兵馬趕往烏撤聲援郭英。元梁王把匝剌瓦爾密得知達里麻戰敗的消息後無心守城，直接逃到了羅佐山。恰逢右丞相驢兒剛從曲靖回來，他告訴梁王明軍的士氣有多麼多麼強盛，梁王聽後絕望的感慨道：「生是元朝人，死也是元朝臣。」說完，他將自己身上的龍袍脫下用火燒了，又逼妻子跳進滇池自溺而死，自己則和左丞相達的，右丞相驢兒向北方拜了一拜，最後刎頸自殺了。
元朝藩王里，數梁王死的最爲壯烈，所以《明史·梁王列傳》裡特別記載了這一段。
藍玉、沐英來到板橋時，右丞相觀音保出來投降，藍玉整軍入城，又攻下了臨安等地。這時郭英、胡海、陳桓等人已經進入到赤水河，他們伐木造船，準備半夜渡江。傅友德帶著大軍趕來支援，元右丞相實卜內心慌亂，立即逃走了。傅友德等人隨即攻下了烏撤一帶。後來實卜見烏撤沒有城牆，又帶人前來圍攻。傅友德依山爲營，讓士兵先不要出擊，等實卜的士氣弱了再出戰，這是彼竭我盈之計。實卜打不過大軍，只好掉頭離去。途中正好遇上芒部土酋前來支援，實卜於是又折回來發起進攻。這下可惹惱了明軍，他們立即將土酋的隊伍打得抱頭鼠竄，實卜又落荒而逃，不敢再回來了。
傅友德接著又拿下了七星關，附近的蠻人部落，如東川、烏蒙、芒部等統統都望風歸降。
雲南境內，大部分地方都已經平定了，除了大理。
洪武十五年閏二月，藍玉、沐英率軍從雲南進攻大理，土酋段世，帶兵把守下關，守御甚是牢固。沐英仔細觀察了形勢，料定硬碰硬很難拿下，於是就別出奇兵，對王弼、胡海兩將各授密計。
原來大理城依山傍水，不僅前有點蒼山，後有洱海，而且還有上下（龍首、龍尾）二關，號稱天險，易守難攻。
王弼和胡海領命分道而去，依計而行。王弼祕密進入上關，胡海悄悄登上點蒼山，全都避開大道，從小道攀緣而上。段世是頭蠻牛，只知道防著下關，誰知王弼、胡海已經帶人繞到自己背後，從裡面殺出來了，沐英也乘機從外面殺入，兩路夾擊，不久就將段世活捉。段世被擒，大理城隨即被攻下。沐英接著又派人攻取了鶴慶、麗江，破了石門關和金齒。雲南因而全部被平定。
沐英和藍玉一起回到雲南，和傅友德等人在滇池會軍，聯名向太祖報捷，並籌辦善後事宜。不久，接到太祖的詔諭，令傅友德、藍玉等人班師回朝，留下沐英鎮守雲南。傅友德等人告辭離去。
沐英治理雲南十分盡力，他設立烏撒、畢節二衛，開墾荒地屯駐兵馬，賦稅合理，百姓安居樂業，對他讚不絕口。太祖念沐英有功，於是命沐氏子孫世世代代鎮守雲南。
當時雲南邊境有一個平緬部，和金齒接壤，以前和中國曆朝歷代都沒有聯繫，直到元朝派人去招降，當地的土酋才被封爲宣慰司。元末的宣慰司叫思倫發，他聽說金齒向明軍投降了後，就也跟著投降了，太祖命他繼續做宣慰使，並管轄麓川地區。
日子久了，思倫發漸漸桀驁不馴了起來，居然還想要造反。
思倫發有次帶著十多萬人入侵景東，都督馮誠不幸戰敗，連千戶王昇也戰死了。沐英正準備親自出兵討伐時，太祖傳來詔諭說，讓他守住要害之地，以逸待勞就可以了。沐英聽命，隨即在楚雄到景東的路上每隔一百里設一處營，重兵把守，嚴加防範。思倫發見無縫可鑽，只好折了回去，接下來一兩年都沒有動靜。
後來，思倫發又進攻摩沙勒寨，沐英令都指揮寧正迎戰，結果大破敵軍，思倫發引以爲恥，竟然帶著全部的三十萬人前來攻打定邊。沐英接到急報，派出三萬精兵日夜兼程趕去迎戰。當都督馮誠正在敵人營前嚴陣以待時，敵營內忽然有一萬人驅趕著三十多頭大象奔了出來，揚起一片塵土。
馮誠正想往回撤，前鋒張因卻不慌不忙地朝對面射了一箭，射中一隻象的左膝，象立刻跪倒在地，張因緊接著又射了一箭，這次射中了敵軍主帥。馮誠見這招管用，忙下令讓士兵紛紛射箭。最後張因大勝而歸，還成功俘獲一隻象。沐英知道後大喜說：「敵人也就這些招數，我們肯定能夠破敵。」隨即下令將三排火銃神機箭排列在一起，然後將大軍分爲三隊，馮誠在中，寧正在左，湯昭在右。安排妥當後，沐英下令再次出擊。
敵軍這次還是驅趕著象羣出戰，象的身上披著戰甲，兩旁有槊，用來進攻。雙方開始交戰，象羣一出，明軍就開始輪番放箭，聲震山谷。象羣受到攻擊後嚇得四散奔逃，敵軍很快潰不成軍。頭目昔剌帶著幾個騎兵來單挑明軍，沐英在高處看到後，取下自己的佩刀，命左右去取昔剌的首級來。昔剌見一個人握著刀直奔他而來，心裡暗想不好，只好硬著頭皮上。
明軍一聲令下，將士們以一當百，拼命殺敵。蠻人大敗，俘獲一萬多人和三十七頭象。思倫發不知去向。沐英回去休養了幾個月後，打算帶兵深入，思倫發得知消息後嚇得不輕，忙來請罪，並承諾說願意每年進貢象、馬、白銀、金子等東西，沐英這才放過了他，讓他回去好好做宣慰使。
話分兩頭，元順帝愛猷識理達臘在洪武十一年夏季去世，他的兒子脫古思帖木兒繼位。
新皇帝上任，免不了又帶人來騷擾邊境。大將軍徐達和副將軍湯和等人奉命討伐，擒住了元平章別里不花，元兵隨即敗退。
沒過多久，徐達、李文忠先後病逝，太祖很悲痛，追封徐達爲中山王、李文忠爲岐陽王，親自爲他們立碑祭祀，力求不留遺憾。
太祖曾這樣對衆人說過：「領命就出，成功了馬上就回，不卑不亢、不貪不色、中正剛毅，與日月同輝，只有大將軍徐達一人。」說完，太祖唏噓不已。
接著，太祖下令封鎖邊境，好幾年沒有出塞。
洪武二十年，元太尉納哈出帶領重兵屢次侵犯遼東，太祖於是命馮國勝爲大將軍，傅友德、藍玉爲左右副將軍帶兵二十萬北征。馮國勝來到通州，派哨兵去松亭關查探，回報說元兵大部分駐紮在慶州，馮國勝於是令藍玉去偷襲。
天下大雪，元兵不曾防備，明軍的突然到來讓他們連逃走都來不及，結果元平章果來被殺，果來之子不蘭奚被抓。明軍得勝回營後，馮國勝召集大軍直逼金山，並派降將乃剌吾去勸納哈出歸降。經過乃剌吾的再三勸說，納哈出終於投降了。
藍玉知道後大喜，並設宴款待他。酒席上，納哈出和藍玉吵了起來，納哈出將酒一把澆到地上，然後操著一口蒙語出了營。鄭國公常茂是馮國勝的妹夫，也在軍中，常茂有個部下懂些蒙語，他偷偷告訴常茂說納哈出想要逃走。
常茂聽了二話不說，上去就是一劍，將納哈出的右臂刺傷了。納哈出怒不可遏，幸虧都督耿忠從中調解，安排納哈出引見大將軍馮國勝。馮國勝對納哈出好言安撫了一番，納哈出才將此事作罷。事後不久，馮國勝帶著納哈出一行人回京城。臨行前，馮國勝命都督濮英帶著三千人斷後。濮英遲走了一步，被納哈出的殘留部下襲擊，濮英剖腹自盡。
馮國勝失去了濮英，沒法和太祖交代，不得已只好把責任推給常茂，說他無端襲擊納哈出，導致部下尋仇。馮國勝將常茂綁去了京城，常茂和馮國勝雖是親戚，但一直不和。回京之後，常茂不服馮國勝的做法，就向太祖揭發了馮國勝的祕事。太祖下令徹查，發現有傳言說馮國勝私藏寶馬，納敵人之女爲妾，還曾派人去找納哈出的妻子索求珠寶。
太祖大怒，將馮國勝、常茂一同懲治了，貶常茂去龍州，收回了馮國勝的大將軍軍印，勒令他返回鳳陽。太祖改命藍玉爲大將軍，唐勝宗、郭英爲副將軍，讓他們繼續北征。大軍來到慶州時，新元帝脫古思正在距離慶州數百里地的捕魚兒海。藍玉得知消息後從小路趕到捕魚兒海附近的百眼井，四處尋找，卻都沒有發現脫古思的蹤影。
藍玉正準備返回，定遠侯王弼說：「將軍帶領十萬人深入沙漠，沒有見到敵人就回去的話，怎麼跟太祖復命呢？」正在藍玉猶豫不決的時候，王弼提議讓將士們在地下生火做飯，不要讓敵人發現有煙火氣，到晚上再突襲。藍玉依計而行。
當晚颳起了大風沙，四周一片昏暗，藍玉命王弼爲前鋒，帶兵前往捕魚兒海。脫古思果然在海岸紮營，明軍吶喊著沖了進去，嚇得脫古思膽戰心驚，急忙帶著家眷就往外逃。元太尉蠻子倉皇帶兵出戰，沒戰幾個回合就人頭落地了。
王弼率大軍追趕，抓住了脫古思的二兒子地保奴和原太子必里禿妃、公主等一百多人，官員三千，男女七萬，斬獲馬牛駝羊十五萬。捷報傳回京師，太祖龍心大悅，派遣使者前去慰勞大軍，並在諭中將藍玉比作衛青、李靖。等到藍玉凱旋歸來，太祖晉封藍玉爲涼國公。
藍玉不僅長得威猛帥氣，還很有大將之才，屢次立功受封。他是常遇春的妻弟，常遇春的女兒又是太子朱標的元妃，所以藍玉和太子也是親戚。有了這層親戚關係，藍玉於是更加驕縱起來。
元妃長得頗有些姿色，藍玉和她早晚接觸，免不了招來勾搭元妃的嫌疑，朝中上下都對他們議論紛紛。太祖知道這件事後，找來藍玉質問。元妃因爲心裡有愧，竟然自縊而死。太祖於是命人在賜給藍玉的鐵券中嵌上玉罪，讓他引以爲戒。藍玉沒有意識到自己的錯誤，依然天天招搖過市，還霸占了東昌的民田。
當時，馬皇后已經去世，太子也早逝，魯王朱檀嗜藥身亡，潭王朱梓叛變後自焚，秦王朱樉被軟禁，周王朱橚被貶遷徙。這一樁樁事情讓太祖焦頭爛額，懊悔不已，直接導致後來的黨獄。連韓國公李善長都被賜死，更不用說驕橫跋扈的藍玉了。真是：
功狗由來未易全，
況兼驕恣挾兵權。
朱公泛棹留侯隱，
畢竟聰明足免愆。
在本章所寫的雲南之事裡，梁王對元朝忠心沒有異議，而明朝拿下雲南全靠沐英，雲南人民也對沐英感恩戴德，在明朝兩百七十多年的歷史裡，沐氏子孫一直鎮守雲南，很少聽到有亂事發生。藍玉和沐英同是疆場上的兄弟，爲明朝立下了汗馬功勞。捕魚兒海一戰，智謀雖然是王弼出的，應付自如的卻是藍玉，不能不說沒有他的功勞。藍玉立下那麼多功，躊躇滿志自然春風得意，但他不懂急流勇退，更不會拱讓自謙，這才導致最後兔死狗烹，做了刀下鬼。太祖雖對藍玉太狠，但也是因爲藍玉對太祖的恩寵處理不當。不然的話，爲什麼沐英的結局和他不一樣呢？